Чорна смерть найбільш відома завдяки катастрофічній хвилі чуми, яка прокотилася Європою між 1347 і 1353 роками та вбила мільйони людей. Але після першого лиха ця хвороба не зникла. Чума поверталася знову і знову протягом понад чотирьох століть, постійно руйнуючи міста, економіку та суспільства по всій Європі та навколишніх регіонах.
Дослідження під керівництвом дослідників з Тартуського університету надає більш детальну інформацію про те, що відбувалося в ті століття. Аналізуючи ДНК бактерії холери, що збереглася в археологічних останках людини, вчені змогли реконструювати, як хвороба поширювалася, еволюціонувала та знову з’являлася багато разів після Чорної смерті.
Стародавня ДНК розкриває багатовікову чуму
Команда реконструювала 26 геномів Yersinia pestisБактерія, що викликає чуму, була знайдена в людських останках в 11 археологічних пам’ятках в Естонії, Росії, Англії, Нідерландах і Швейцарії. Зразки датуються чотирнадцятим – вісімнадцятим століттями, охоплюючи більшу частину періоду, відомого як друга пандемія чуми.
Генетичні дані свідчать про те, що чума не вижила лише в одному місці й поширювалася з одного джерела багато разів. Натомість виявляється, що хвороба знову з’явилася в різних частинах Європи протягом сотень років, потенційно створюючи кілька нових резервуарів, де бактерії можуть зберігатися.
Естонія багато разів страждала. Дослідники знайшли докази того, що холера неодноразово потрапляла в регіон протягом більшої частини другої пандемії холери, що свідчить про те, що зв’язки Естонії з іншими частинами Європи також сприяли передачі хвороби на великі відстані.
Один з найцікавіших екземплярів був знайдений приблизно в 1450-1500 роках. Протягом цього періоду лінії чуми зазнали значного розширення та розділилися на три основні гілки. Ці гілки можуть бути використані для будівництва нових водосховищ Yersinia pestis в популяціях диких гризунів.
Клімат також може впливати на це розширення. Дослідники вказують на можливий фактор посухи Великого Відродження. Дослідження сучасних систем чуми показали, що зміна клімату може вплинути на спалахи серед диких гризунів, які є природними господарями бактерії.
«Ми знайшли докази неодноразового занесення чуми в Естонію наприкінці 14 століття та ідентифікували кілька раніше невідомих генетичних ліній як у міських, так і в сільських районах», — сказала старший автор, професор Крістіна Тамбетс.
Виявлення спалаху стародавньої холери
Головним завданням у вивченні історичних пандемій є визначення того, коли саме з’явилися стародавні інфекції.
Під час пандемії COVID-19 дослідники могли більш детально відстежувати окремі варіанти, оскільки послідовності геномів зазвичай пов’язували з точними датами. Приклади давніх хвороб рідко супроводжуються такою інформацією. Археологічні залишки часто ідентифікують за допомогою радіовуглецевих методів, які можуть створювати часові вікна в десятиліття або навіть більше століття.
«З COVID-19 вчені могли б дуже добре реконструювати поширення окремих штамів, оскільки геноми постачалися з точними часовими мітками. Для історичних пандемій ці позначки часто відсутні або можуть охоплювати понад 100 років, що обмежує нашу здатність інтерпретувати генетичні дані», — пояснив провідний автор доктор Марсель Келлер.
Щоб вирішити цю проблему, команда розробила метод, призначений для звуження цих широких діапазонів датувань. Дослідники досліджували, де окремі геноми холери з’явилися на еволюційному дереві бактерії, і використовували цю інформацію, щоб точно визначити ймовірні дати багатьох зразків.
Це дозволило їм розмістити давні інфекції на точнішій історичній шкалі.
Потім дослідники застосували складний підхід до датування 64 раніше опублікованих геномів холери та 11 секвенованих геномів. Їхня робота є першою систематичною спробою пов’язати майже всі геноми холери, які зараз доступні з 14 по 18 століття, зі спалахами, описаними в історичних записах.
«Ми змогли уточнити інтервали датування для багатьох зразків, що дозволило нам пов’язати їх із конкретними хвилями чуми та спалахами, зафіксованими літописцями у відповідних містах чи регіонах», — сказав історик та автор-кореспондент професор Філіп Славін.
Війна сприяла поширенню чуми по Європі
Генетичний запис також показує, наскільки діяльність людини вплинула на поширення чуми.
Нещодавно проаналізовані геноми надають додаткові докази, що пов’язують спалахи з Тридцятилітньою війною (1618-1648) і Великою Північною війною (бл. 1700-1721). Армії, переміщені громадяни, біженці та торговці часто подорожували одним маршрутом, дозволяючи хворобам переміщатися між регіонами.
«Побачимо як Yersinia pestis він розгалужується під час періодів конфліктів і поширюється вздовж маршрутів, якими подорожують солдати та переміщені особи», – сказала старший автор доктор Крістіана Л. Шайб.
Отримані дані додають нові відомості про спалахи чуми, пов’язані з Північною війною. Наприклад, під час облоги Таллінна в 1710 році хвороба вбила шведських і російських солдатів, а також цивільне населення.
У сукупності докази свідчать про те, що чума була не просто середньовічною катастрофою. Він залишався постійною загрозою для поколінь, повертаючись знову і знову до спільнот по всій Європі.
Чому історія холери все ще має значення
Холера більше не є серйозною загрозою громадському здоров’ю в Європі, але Yersinia pestis не пішла зі світу. Бактерія все ще зберігається в природних резервуарах гризунів у кількох регіонах.
Розуміння того, як чума виникла після Чорної смерті, існувала протягом століть і зрештою зникла з Європи, може допомогти вченим краще зрозуміти довгострокову поведінку інфекційних захворювань, кажуть дослідники.
Пов’язування стародавніх геномів із зареєстрованими спалахами та потенційними резервуарами тварин може виявити, як хвороби виникають, поширюються, з’являються та зберігаються протягом тривалих періодів часу. Ця інформація також може покращити сучасний епіднагляд за хворобами та зусилля з контролю в районах, де все ще поширена холера.
Одужання після другої пандемії холери
Проект об’єднав дослідників і докази з кількох країн і наукових областей. Приклади та досвід взяті від колег з усієї Європи, зокрема вчених з Кембриджського університету та дослідницьких партнерів у Нідерландах і Швейцарії.
Поєднавши давній аналіз ДНК, археологію, історичні записи та радіовуглецеве датування, дослідники створили те, що вони описують як найповнішу генетичну картину другої пандемії чуми на сьогоднішній день.
Отримані дані вказують на хворобу, яка неодноразово перетинала кордони, мутувала в нові покоління, відстежувала рух людей і продовжувала формувати Європу протягом століть після того, як сама Чорна Смерть закінчилася.
